[u]قصة المحقق كونان (سينشي كودو)[/u]
font=Arial]
أنا المتحري طالب الثانوية سينشي كودو، بينما كنت مع صديقة طفولتي ران موري في مدينة الملاهي لمحت رجلًا يرتدي الأسود يقوم بأعمال مريبة فتبعته, وبينما أنا منشغل في مراقبة الصفقة السرية التي كان يجريها هاجمني شريكه من الخلف ولم أنتبه له. أجبروني على تناول عقارًا سامًّا ثم هربوا. وعندما استيقظت كان جسدي قد تقلص، إن علمت المنظمة أني مازلت حيًّا فكل الذين من حولي سيكونون في خطر، ساعدني الدكتور أغاسا في إخفاء شخصيتي، وعندما سألتني ران عن اسمي أجبتها كونان إيدوجاوا ،ولكي أبحث عن رجال المنظمة السوداء قررت الذهاب للعيش عند والد ران لأنه يملك وكالة للتحريات.
تبدأ القصة في أول حلقة بظهور شخصية سينشي كودو ذو السبعة عشر عامًا، طالب في المدرسة الثانوية ومتحرٍ يساعد الشرطة والمفتش ميغوري في حل بعض القضايا مشهور في منطقته بذكاءه وعبقريته التي تفاجئ الجميع باستنتاجات تخالف التوقعات، و في يوم من أيام العطلة خرج مع صديقة طفولته ران موري في مدينة الملاهي، وحدثت جريمة قتل داخل الأفعوانية وحلها كالعادة بذكاءه ومهارته، وبينما كانوا هناك لمح سينشي كودو رجل ذو ملابس سوداء يقوم بعملية ابتزاز. فأراد معرفة القصة، فما لبث إلا أن ضرب من الخلف وسقط مغشيا عليه، ومن ثم أُجبر على تناول عقار جديد لم يستخدم من قبل إلا على الفئران وظن الرجل ذو الملامح السوداء أنه سيقتله ولن يترك فيه أثر للتسمم لكن العقار تسبب في تقلص جسمه ليصبح فتى في السابعة من عمره وفي تلك الحادثة في مدينة الملاهي هي بداية ولادة كونان وتغير حياة سينشي كودو.
وعندما كان في منزل صديقه الدكتور أغاسا دخلت صديقته ران موري لتسأل عن سينشي، فسألت كونان عن اسمه فأجابها بـ كونان إيدوجاوا وسبب اختياره لاسم كونان لأن سينشي كان يحب شخصية شارلوك هولمز لمؤلفه كونان دويل واسم إيدوجاوا على اسم الناقد الياباني وكاتب روايات التحري والغموض إيدوجاوا رامبو (en). قرر كونان أن يعيش مع ران في منزل أبيها الذي يعمل متحريًا ليتسنى له معرفة هذه المنظمة. فدخل مدرسة تيتان الإبتدائية وأصبح عضوًا في فريق المحققين الصغار.
لاحقًا، تظهر شخصية جديدة, ألا وهي شيهو ميانو ولقبت هايبارا وهي باحثة كيميائية وعضوة سابقة مع المنظمة السوداء -هي التي قامت بتطوير العقار APTX-4869 والذي تسبب في تقلص سينشي- ولكنها تمردت بسبب قتل المنظمة لأختها أكيمي ميانو. ومن ثم تتوالى الأحداث ويصبح كونان في صف الـ FBI بعد أن ساعد العميلة جودي سانتيمليون في البحث عن المنظمة وفي تخليصها من فخ عضوة المنظمة السوداء بلموت. فأمسكوا بواحدة من أفراد المنظمة السوداء اسمها ميزوناشي رينا ولقبها "كير"، لكن تبين لهم أنها عميلة للـ CIA. فتعقد اتفاقًا بأن تزود الـ FBI بالمعلومات في مقابل مساعدتها مرة أخرى في دخول المنظمة وحماية أخيها الصغير هوندو إيسوكي من خطر المنظمة بموضعه تحت برنامج حماية الشهود.
[/font]